pidibble package

Subpackages

• pidibble.resources package

Submodules

• pidibble.baseparsers module
  • ListParser
    • ListParser.parse()
  • StringParser
    • StringParser.parse()
    • StringParser.report_field_error()
    • StringParser.report_record_error()
  • list_parse()
  • safe_float()
  • str2int_sig()
• pidibble.baserecord module
  • BaseRecord
    • BaseRecord.empty()
    • BaseRecord.pstr()
  • BaseRecordParser
    • BaseRecordParser.add_fields()
    • BaseRecordParser.parse()
  • rstr()
• pidibble.hex module
  • hex_reset()
  • str2atomSerial()
• pidibble.mmcif_parse module
  • MMCIFDict
    • MMCIFDict.get()
  • MMCIF_Parser
    • MMCIF_Parser.gen_dict()
    • MMCIF_Parser.parse()
    • MMCIF_Parser.update_ids()
    • MMCIF_Parser.update_maps()
  • rectify()
  • resolve()
  • split_ri()
• pidibble.pdbparse module
  • PDBParser
    • PDBParser.parsed
    • PDBParser.mappers
    • PDBParser.pdb_lines
    • PDBParser.cif_data
    • PDBParser.fetch()
    • PDBParser.parse()
    • PDBParser.parse_PDB()
    • PDBParser.parse_base()
    • PDBParser.parse_embedded_records()
    • PDBParser.parse_mmCIF()
    • PDBParser.parse_tables()
    • PDBParser.parse_tokens()
    • PDBParser.post_process()
    • PDBParser.read()
    • PDBParser.read_PDB()
    • PDBParser.read_mmCIF()
  • get_symm_ops()
• pidibble.pdbrecord module
  • PDBRecord
    • PDBRecord.base_parse()
    • PDBRecord.continuation
    • PDBRecord.continue_record()
    • PDBRecord.get_token()
    • PDBRecord.newrecord()
    • PDBRecord.parse_embedded()
    • PDBRecord.parse_tables()
    • PDBRecord.parse_tokens()
  • PDBRecordDict
    • PDBRecordDict.setdefault()
    • PDBRecordDict.update()
  • PDBRecordList
    • PDBRecordList.append()
    • PDBRecordList.extend()
    • PDBRecordList.insert()
  • capture_record()
  • gather_token()
  • header_check()
  • header_or_token()
  • tokengroup
    • tokengroup.add_token()